Análise filogenética de isolados patogênicos da família botryosphaeriaceae em cacau (Theobroma cacao L.) na região de Los Ríos
DOI:
https://doi.org/10.18779/cyt.v15i2.583Palavras-chave:
Cancro, cacau, Região ITS, EF1-a, filogeniaResumo
Problemas fitossanitários causados por fungos vasculares que afetam as plantações de cacau CCN-51 tornaram-se muito importantes nas últimas décadas, evido aos danos que causam. Espécies da família Botryosphaeriaceae estão associadas a cancros e ressecamento de gemas, morte, podridão dos frutos e podridão do pescoço, sintomas que têm sido observados em diferentes áreas e que reduzem a produção vegetal. Para caracterizar e identificar isolados patogênicos deste fungo a nível molecular, foram amostradas cinco árvores sintomáticas selecionadas em fazendas localizadas nos cantões: Buena Fe, Mocache, Quevedo, Quinsaloma e Valencia na província de Los Ríos, obtendo 15 isolados de do qual o DNA foi extraído e utilizou sequências das regiões ITS (Espaçador transcrito interno) e EF1-a (fator de alongamento alfa). Os tamanhos das sequências foram verificados por eletroforese e as identidades putativas de 3 espécies foram estabelecidas usando a ferramenta de alinhamento local básico (BLAST). As árvores filogenéticas construídas com os algoritmos de máxima verossimilhança e vizinhos mais próximos, com os isolados em cinco cantões, confirmaram a presença de Lasiodiplodia theobromae em Quevedo, Diplodia seriata em Quinsaloma e Botryosphaeria dothidea em Valencia, Mocache e Buena Fe, evidenciando uma politomia entre eles.
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Referências
Alvindia, D., & Gallema, F. (2017). Lasiodiplodia theobromae causes vascular streak dieback (VSD)–like symptoms of cacao in Davao Region, Philippines. Australasian Plant Disease Notes, 12, 54. https://doi.org/10.1007/s13314-017-0279-9
Barnett, H., & Hunter, B. (2010). Illustrated ggenera of imperfect fungi (1972 Burgess Publishing Company (ed.)).
Brooks, J. (2018). Probability concepts explained: Maximum likelihood estimation. Towards Data Science.
Caicedo, J. D., Lalangui, K. P., Pozo, A. N., Cevallos, P. A., Arahana, V. S., & Méndez, K. S. (2017). Multilocus molecular identification and phylogenetic analysis of Colletotrichum tamarilloi as the causal agent of Tamarillo (Solanum betaceum) anthracnose in the Ecuadorian highlands. European Journal of Plant Pathology, 148(4), 983–996. https://doi.org/10.1007/s10658-017-1155-3
Carbone, I., & Kohn, L. (2014). A method for designing primer sets for speciation studies in filamentous ascomycetes. Mycological Society of America, 91(3), 553–556.
Chou, C. (1988). Crown wilt of pinus radiata associated with diplodia pinea infection of woody stems. European Journal of Forest Pathology, 17(7), 398–411.
Crous, P., Slippers, B., Wingfield, M., Rheeder, J., Marasas, W., Philips, A., Alves, A., Burgess, T., Barber, P., & Groenewald, J. (2006). Phylogenetic lineages in the Botryospha … Phylogenetic lineages in the Botryosphaeriaceae Phylogenetic lineages in the Botryospha …. Mycology, 55, 235–253. http://dx.doi.org/10.1016/j.funbio.2016.11.001%0Ahttp://dx.doi.org/10.3114/ sim0020%0Ahttp://dx.doi.org/10.1016/j.funbio.2016.08.011%0Ahttp://www. mycosphere.org/pdf/Mycosphere_7_7_13.pdf%0Ahttp://www.
E. A, B., & F. F, H. (1981). Pathogenicity and histopathology of Botryosphaeria dothidea on apple stems. Phytopathology, 71(4), 375–379. https://doi.org/10.1094/phyto-71-375
Glass, N., & Donaldson, G. (1995). Development of primer sets designed for use with the PCR to amplify conserved genes from filamentous ascomycetes. Applied and Environmental Microbiology, 61(4), 1323–1330. https://doi.org/10.1128/aem.61.4.1323-1330.1995
Guamán, M. (2018). Cararacterización morfológica, molecular y de resistencia a fungicidas de Colltotrichum sp., aislado de tomate de árbol (Solanum betaceum) [Universidad Central del Ecuador]. http://www.fao.org/3/I8739EN/i8739en.pdf%0Ahttp://dx.doi.org/10.1016/j. adolescence.2017.01.003%0Ahttp://dx.doi.org/10.1016/j.childyouth.2011.10.007 %0Ahttps://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/23288604.2016.1224023%0A http://pjx.sagepub.com/lookup/doi/10
Guerrero, G. (2015). El cacao ecuatoriano su historia empezó antes del siglo XV. Revista Líderes. https://www.revistalideres.ec/lideres/cacao-ecuatoriano-historia-empezo-siglo.html
KiWoo, K., EunWoo, P., & KyungKu, A. (1999). Pre-penetration behavior of Botryosphaeria dothidea on apple fruits. Plant Pathology Journal, 15(4), 223–227.
Marques, M., Lima, N., De Morais, M., Michereff, S., Phillips, A., & Câmara, M. (2013). Botryosphaeria, Neofusicoccum, Neoscytalidium and Pseudofusicoccum species associated with mango in Brazil. Fungal Diversity, 61, 195–208. https://doi.org/10.1007/s13225-013-0258-1
Mehl, J., Wingfield, M., Roux, J., & Slippers, B. (2017). Invasive everywhere? Phylogeographic analysis of the globally distributed tree pathogen Lasiodiplodia theobromae. Forests, 8(145), 1–22. https://doi.org/10.3390/f8050145
Palero, F., & Crandall, K. (2009). Phylogenetic inference using molecular data. 9–32. https://doi.org/10.1201/9781420092592-c5
Phillips, A. J. L., Alves, A., Abdollahzadeh, J., Slippers, B., Wingfield, M. J., Groenewald, J. Z., & Crous, P. W. (2013). The Botryosphaeriaceae: genera and species known from culture. Studies in Mycology, 76, 51–167. https://doi.org/10.3114/sim0021
Picos, P., García, R., León, J., Sañudo, A., & Allende, R. (2015). Lasiodiplodia theobromae en cultivos agrícolas de México: Taxonomía, Hospedantes, Diversidad y Control. Revista Mexicana de Fitopatología, 33(1), 54–74.
Pino, S. (2010). Ecuador the land of fine cocoa ‘Arriba’ (Vol. 7, Issue 1). https://www.researchgate.net/publication/269107473_What_is_governance/ link/548173090cf22525dcb61443/download%0Ahttp://www.econ.upf.edu/~ reynal/Civil wars_12December2010.pdf%0Ahttps://think-asia.org/handle/11540/8282%0Ahttps://www.jstor.org/stable/41857625
Rodríguez, E. (2013). Construcción de árboles filogenéticos (pp. 1–97). https://www.tamps.cinvestav.mx/~ertello/bioinfo/sesion13.pdf
Saitou, N., & Nei, M. (1987). The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. Molecular Biology and Evolution, 4(4), 406–425. https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a040454
Sandoval-Sánchez, M., Nieto-Ángel, D., Sandoval-Islas, J. S., Téliz-Ortiz, D., Orozco-Santos, M., & Silva-Rojas, H. V. (2013). Hongos asociados a pudrición del pedúnculo y muerte descendente del mango (Mangifera Indica L.). Agrociencia, 47, 61–73.
Santiago, D., Valadez, E., & Cibrián, D. (2015). Identificación molecular del complejo Botryosphaeria sp. asociado a cancros y secamiento de yemas en Eucalyptus sp. Revista Mexicana de Ciencias Forestales, 6(32), 93–106.
Schoch, C. L., Seifert, K. A., Huhndorf, S., Robert, V., Spouge, J. L., Levesque, C. A., Chen, W., & Fungal Barcoding Consortium. (2012). Nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region as a universal DNA barcode marker for fungi. PNAS, 109(16), 6241–6246. https://doi.org/10.1073/pnas.1117018109
Silva, P. (2018). Caracterización genotipica y de virulencia de Colletotrichum tamarilloi y Colletotrichum sp. causantes de la antracnosis en tomate de árbol. Universidad Central del Ecuador.
Slippers, B., & Wingfield, M. J. (2007). Botryosphaeriaceae as endophytes and latent pathogens of woody plants: diversity, ecology and impact. Fungal Biology Reviews, 21, 90–106. https://doi.org/10.1016/j.fbr.2007.06.002
Suarez, G. (2016). Botryosphaeriaceae asociadas a la muerte de ramas en plantaciones de Eucalyptus globulus Labill . en la región del Biobío y de La Araucania (Chile) [Universidad de Concepción]. In Universidad de Concepción. http://repositorio.udec.cl/bitstream/11594/2000/3/Tesis_Botryshaeriaceae _Asociadas_a_la_muerte_de_ramas.Image.Marked.pdf
Walker, J. (1980). The coelomycetes. Fungi imperfecto with Pycnidia, Acervuli and Stromala. Australasian Plant Pathology, 9(1), 120–121.
White, T. J., Bruns, T., Lee, S., & Taylor, J. (1990). Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal rna genes for phylogenetics. PCR Protocols, 315–322. https://doi.org/10.1016/b978-0-12-372180-8.50042-1
Wright, A. F., & Harmon, P. F. (2010). Identification of species in the Botryosphaeriaceae family causing stem blight on southern highbush blueberry in Florida. Plant Disease, 94(8), 966–971. https://doi.org/10.1094/PDIS-94-8-0966
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