La microbiota del suelo se clasificó aproximadamente entre tres grupos (6,0 x 10
8
o más, 2,0 –
6,0 x 10
8
y 2,0 x 10
8
o menos). Es decir, las biomasas bacterianas de 3 cantones (Alamor,
Gonzanamá y Macará) fueron de 27,6 ± 5,3, 7,1 ± 2,5 y 6,4 ± 2,1x 10
8
células/g-suelo, las
biomasas bacterianas de Celica, Loja y Zapotillo fueron de 5,6 ± 2,4, 5,2 ± 1,8 y 3,4 ± 1,1 x 10
8
células/g-suelo, las biomasas bacterianas de Saraguro, Paltas y Catamayo fueron muy bajas [0,5
± 0,2, 1,6 ± 0,5 y 0,5 ± 0,2 x 10
8
células/g-suelo]. Utilizando esta categorización, se observó
diferencia significativa en el contenido de DNA en los tres grupos de cantones (prueba Kruskal-
Wallis
2
= 10.417, df = 2, p = 0.00547) (Figura 4).
El 35% (9 de 26 muestras) presentaron mayores biomasas bacterianas que el valor de 6,0 x 10
8
células/g-suelo, el 15% (4 de 26 muestras) biomasas bacterianas entre 2,0 y 6,0 x 10
8
células/g-
suelo, y el 50% (13 de 26 muestras) mostró biomasas bacterianas menos de 2,0 x 10
8
células/g-
suelo.
4. DISCUSIÓN
El N es uno de los nutrientes esenciales para las plantas, está contenido en compuestos
orgánicos, que deben descomponerse en nitrógeno inorgánico (mineralización) antes de ser
utilizado por las plantas, en el suelo se descompone finalmente en nitrato a través del nitrógeno
amoniacal y nitrito mediante la acción de los microorganismos, son numerosos los
microorganismos que habitan en el suelo y están directamente involucrados en mineralización de
compuestos orgánicos [15], los cuales habitan aproximadamente en el mismo número
independientemente de altitud, latitud y naturaleza del suelo [16]. Las investigaciones sobre el
DNA ambiental (eDNA) no solo se han aplicado para la detección de especies de
microorganismos en el suelo, sino también para la estimación de la biomasa bacteriana (recuentos
bacterianos) porque la concentración de eDNA se correlaciona positivamente con la biomasa
bacteriana o la abundancia de microorganismos [12], confirmando que la cantidad de eDNA
refleja la presencia o no de microorganismos (biomasa bacteriana) en el suelo [17].
Zhou [18] extrajeron 10,7 – 17,5 g DNA de 1 g del suelo utilizando CTAB y PVPP (polivinil-
pirrolidona) como surfactantes [14]. Miller [19] usaron como tampón de extracción el surfactante
SDS junto con disolventes orgánicos (fenol y cloroformo) además de la enzima de lisozima,
obteniendo 14,7 g DNA/g-suelo [14]. Por otro lado, [13] y [1], desarrollaron un método simple
de extracción de eDNA del suelo ("Slow-Stirring Method") que no requiere los disolventes
orgánicos y sugieren que la microbiota del suelo es útil como un criterio para evaluación de la
fertilidad del suelo. Usando ese método, ellos cuantificaron el eDNA de 2000 muestras de Japón,
y reportaron el promedio de biomasa bacteriana de 6,2 x 10
8
células/g-suelo [13], [1]. En esta
investigación, cuantificamos eDNA en el suelo agrícola en nueve cantones de la provincia de Loja
en Ecuador por el método simple sin usar disolventes orgánicos establecido por Aoshima [13], el
valor promedio de biomasa bacteriana de los 26 suelos fue 6,0 x 10
8
células/g-suelo, el valor
promedio encontrado es menor con la investigación contrastada
La mineralización del nitrógeno orgánico es extremadamente importante para desarrollar una
agricultura con buen rendimiento en la que intervienen los microorganismos del suelo. Sin
embargo, la mineralización del nitrógeno orgánico difícilmente ocurrirá en suelos con biomasa
bacteriana de 2,0 x 10
8
células/g-suelo o menor [19], [20] y [1]. El 50% de los 26 suelos medidos
en este estudio mostraron una biomasa bacteriana menor de 2,0 x 10
8
células/g-suelo, muestras de
suelo procedentes de Saraguro, Paltas, Celica, Gonzanamá, Catamayo, Macará y Zapotillo, estos
datos sugieren que el mejoramiento del suelo es necesario en estos sectores.
Actualmente, existe gran expectativa en la agricultura orgánica, sin embargo es necesario
mantener las bacterias y hongos del suelo, el aumento de la microbiota y la mejora de sus
actividades cultuales lo mantendrán más productivo, esperamos que este primer trabajo sea útil